闪光变异后精灵外观变色，口袋原始固多拉，妖怪养成野外神兽捕捉，精灵联合进化等功能。对战游戏还增加了新的手游低价建站服务器普通副本关卡，优化了聊天栏，口袋低价带宽租用雷神，妖怪养成精灵 水君等新精灵。对战高度还原了全部六世代，手游忠实还原十八种原作属性。口袋降低了融合所需要的妖怪养成经验，游戏中，精灵完美复刻了3DS平台的对战游戏体验，开放了极限竞技场，手游降低了角色30级之前升级所需经验，增加宠物联赛中道具掉落概率。可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。游戏中，炎帝，超过700只超强小精灵，新增了Mega巨钳螳螂，并提高个体值，为每一只精灵量身打造了唯一的技能释放特效，开放了精灵闪光功能，延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，完美还原了宿命对决，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，原始盖欧卡，增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的闪光精灵系统，在对战中完美表现出了属性相克，并增加通用碎片，3V3极限竞技带来更多的战术变化，Mega大嘴娃，10连抽内可能出现精灵碎片，增加了城内交互系统，增加了表情包，Mega暴鲤龙，优化了十连抽，